Между микроэкономической и мезоэкономической политикой существует важное концептуальное различие. Микроэкономическая теория основана на конкуренции между агентами как основном факторе принятия решений и основной движущей силе развития. Такое понимание развития страдает определенной односторонностью. Не менее важной силой развития служит кооперация – сотрудничество между агентами. В наибольшей степени оно реализуется в интеграции, в наименьшей – в принятии компромиссных решений по поводу конкретной сделки. Мезоэкономический взгляд выделяет как раз эту составляющую межагентских отношений. Исходя из сказанного, можно утверждать, что целью действий правительства и других органов федерального управления в настоящее время должна быть не макростабилизация, к которой стремилось правительство в конце 1990-х годов, не микростабилизация, к которой стремятся многие директора и бизнесмены; но в первую очередь мезостабилизация, т.е. формирование устойчивых мезоэкономических систем, стабильных как по составу участников и внутренних факторов развития, так и по траектории движения. Для этого государственная промышленная политика должна предусматривать поддержку создания и функционирования отраслевых мезоэкономических альянсов производителей, потребителей, инженерно-технических работников, укрепление отраслевых профсоюзов.